解题思路：ATP的结构简式中，A代表腺苷，P代表磷酸，-代表普通磷酸键，～代表高能磷酸键．ATP中有3个磷酸，2个高能磷酸键，且2个高能磷酸键为远离腺苷的磷酸之间．
A、ATP分子中只有高能磷酸键储存着大量能量，A错误；
B、三磷酸腺苷可简写A-P～P～P，B错误；
C、ATP中大量的能量储存在高能磷酸键中，腺苷和磷酸基团之间为普通磷酸键，C错误；
D、ATP中大量的能量储存在高能磷酸键中，D正确．
故选：D．
点评：
本题考点： ATP的化学组成和特点．
考点点评： 解答本题的关键是掌握ATP的结构和特点．