解题思路：根据题意分析可知：由于多肽分子式是C21HXOYN4S2，且列举的氨基酸中都只含1个N原子，所以该多肽由4个氨基酸合成．明确知识点，梳理相关的基础知识，结合问题的具体提示综合作答．
A、由多肽分子式中S2可推知该多肽中应包括2个半胱氨酸（C3H7O2NS），说明该多肽是由3种氨基酸构成，所以该多肽水解后能产生3种氨基酸，A正确；
B、根据多肽分子式C21HXOYN4S2，由于含有2个半胱氨酸，所以从C21可知另外两个氨基酸是苯丙氨酸（C9H11O2N）和亮氨酸（C6H13O2N），因此该多肽中H原子数和O原子数分别是32和5，B正确；
C、该多肽是由4个氨基酸脱水缩合而成，所以叫四肽化合物，C错误；
D、该多肽在核糖体上由4个氨基酸脱水缩合形成，同时产生3个水，所以形成过程中相对分子质量减少了18×3=54，D正确．
故选：C．
点评：
本题考点： 蛋白质的合成——氨基酸脱水缩合．
考点点评： 本题考查多肽的相关知识，意在考查学生的识记能力和判断能力，运用所学知识综合分析问题的能力．