光合色素(photosynthetic pigment) 在光合作用中参与吸收、传递光能或引起原初光化学反应的色素.光合色素存在于叶绿体基粒,包含叶绿素、反应中心色素和辅助色素.
光合色素：在光合作用中参与吸收、传递光能或引起原初光化学反应的色素.高等植物和大部分藻类的光合色素是叶绿素a,b和类胡萝卜素;在许多藻类中除叶绿素a,b外,还有叶绿素c,d和藻胆素,如藻红素和藻蓝素；在光合细菌中是细菌叶绿素等；在嗜盐菌中则是一种类似视紫质的色素11-顺-视黄醛(11-cis-retinal).
光合色素结构：
叶绿素a,b和细菌叶绿素都由一个与镁络合的卟啉环和一个长链醇组成,它们之间仅有很小的差别.类胡萝卜素是由异戊烯单元组成的四萜,藻胆素是一类色素蛋白,其生色团是由吡咯环组成的链,不含金属,而类色素都具有较多的共轭双键.除盐细菌中的假视紫红质(一种胡萝卜素)外,它们都不直接参与光化学反应,只参与光的吸收和能量的传递,所以曾称为辅助色素.但叶绿素b和一部分叶绿素a也不直接参加光化学反应,也可看作辅助色素.几类色素的吸收光谱不同,特别是藻红素和藻蓝素的吸收光谱与叶绿素的相差很大,这对于在海洋里生活的藻类适应不同的光质条件,有生态意义.