解题思路：A．根据构成物质的基本粒子来分析；
B．根据分子和原子不能比较大小考虑；
C．根据原子的结构来分析；
D．根据原子中各粒子的质量来分析．
A．分子、原子和离子是构成物质的三种基本粒子，三种粒子都可以直接构成物质，故说法错误；
B．有的物质的分子比有的物质的原子大，有的物质的原子比有的物质的分子大，所以分子和原子不能比较大小，故说法错误；
C．氢原子中没有中子，故说法错误；
D．电子的质量约为质子质量的[1/1836]，故原子的质量主要集中在原子核上，故说法正确．
故选D．
点评：
本题考点： 分子、原子、离子、元素与物质之间的关系；原子的定义与构成；分子和原子的区别和联系．
考点点评： 本题考查了分子、离子和原子的有关知识，完成此题，可以依据已有的知识进行分析解答．