(1)∵抛物线y=-x2+bx+c与x轴交与A(1,0),B(-3,0)两点,
∴
?1+b+c=0
?9?3b+c=0,
解得
b=?2
c=3,
∴该抛物线的解析式为y=-x2-2x+3;
(2)令x=0,则y=3,
所以,点C的坐标为(0,3),
设直线BC的解析式为y=kx+b,
则
?3k+b=0
b=3,
解得
k=1
b=3,
所以,直线BC的解析式为y=x+3,
设E点横坐标为x,
EF的长度为L=-x2-2x+3-(x+3)=-x2-3x,
∵E为抛物线B、C两点间图象上的一个动点(不与B、C重合),
∴-3<x<0,
∴L关于x的函数关系式为L=-x2-3x(-3<x<0);
(3)∵EF的长度L=-(x+[3/2])2+[9/4],
∴当x=-[3/2]时,线段EF的值最大为[9/4],
此时,-(-[3/2])2-2×(-[3/2])+3=[15/4],
所以,点E(-[3/2],[15/4]).