题1,胰蛋白酶、糜蛋白酶水解后氨基酸后“分别为”给人的感觉有歧义,好像是构成一个顺序一样.仔细分析一下题,显然从题意来看水解的片段组成没顺序.
DNS-Ala不用说N端第一个氨基酸Ala确定了.胰蛋白酶切割左边精、赖氨酸位点,糜蛋白酶切割左边phe、trp、tyr位点.
糜蛋白酶水解产生游离的ASP 不用说八肽C端-phe-ASP顺序确定了.产物四肽含有phe,phe一定在四肽的C末端确定了.
胰蛋白酶水解产物Lys, Ala, Ser,显然Lys一定在C末端,这三肽顺序就确定ala-ser-Lys.又由于四肽包含了三肽Lys, Ala, Ser.显然四肽顺序为Ala-ser-Lys-Phe
现在只剩下2个氨基酸顺序没确定,又胰蛋白酶另一个水解三肽为Gly, Phe, Lys,而这个三肽中的phe又是必定和ASP相连,Gly和Lys被两个phe夹着,要保证胰蛋白酶水解3,3,2的结果,故八肽顺序为：Ala-ser-Lys-Phe-Gly-Lys-Phe-Asp
题2
N末端为Glu而十一肽.Lys只有1个,其为突破口(asp,lys) (arg,lys) 可知Lys必然被夹着,又(asp,glu,lys) 故glu-ASP-Lys-Arg, 当然N C末端还无法确定
由(ser,thr)(arg,thr)可知Thr只有一个也必然被夹着又由于(arg2,thr) 可知为Ser-Thr-Arg-Arg.2个Arg已确定故：glu-Asp-Lys-Arg-Arg-Thr-Ser.又(ala,asp,ser)(ala,asp,gly)可知Ser连接(ala,asp）然后和Gly相连,又(asp,glu,gly)可以确定gly和Asp相连故Ser-Ala-Asp-Gly.又(asp,glu,gly)
可以确定整个顺序Glu-Asp-Lys-Arg-Arg-Thr-Ser-Ala-Asp-Gly-Glu
推到出来两头都有Glu,此题似乎信息无法确定哪端是N端哪端是C端?
题3
2,4-二硝基氟苯处理 N末端为Tyr,三肽序列为Tyr-Gly-Gly.由于胃蛋白酶特异性水解要求两侧都是疏水氨基酸,故此5肽为Leu-Phe-Tyr-Gly-Gly.Phe-Leu-Tyr-Gly-Gly也有可能,不过考虑Phe-Tyr相连的话,疏水性更强位点更容易水解.所以Leu-Phe-Tyr-Gly-Gly
题4
PITC同样作用于N末端.羧肽酶A,B是外切酶作用于羧基端.不能水解则说明倒数第二个氨基酸为Pro.而胰蛋白酶作用得到Lys的C末端.由于含2个Lys故另一个Lys在C末端 故顺序为Glu-Phe-Lys-Pro-Lys 或 Glu-Lys-Phe-Pro-Lys
题5
由PITC可知N端为Ser,胰蛋白酶作用的到Lys的C末端. 故可以确定为ser-Lys-Cys-xx-xx.既然糜蛋白酶作用生成丙氨酸和二肽 即确定为ser-Lys-Cys-Phe-ALa
题6
这是清华大学1998年的试题,大部分生化习题集上都有这个7肽推理题.
不与FDNB反应则是环肽.
环肽被糜蛋白酶切成2段必然是切了2刀.由DNP- Ser和DNP-Lys可知 Ala,Tyr,Ser中的Tyr必在羧基端不然环肽不会断成2断故：Ser-Ala-Tyr, 同理Phe也在羧基端Lys-（Pro,Arg）-Phe ；（Pro,Arg）顺序暂时不确定
由胰蛋白酶作用得到Arg和Lys的C末端,可以确定Lys-Pro-Arg-Phe否则（Pro,Arg）就会分开.又Phe和Ser它们相连故
-Lys-Pro-Arg-Phe-Ser-Ala-Tyr- 所构成的一个环