1．1859年达尔文提出的生物进化论，被列为19世纪自然科学的三大发现之一，具有划时代的意义。用“马克思发现了人类历史的发展规律”同“达尔文发现有机界的发展规律”进行类比，是为了说明马克思发现人类历史的发展规律的划时代意义。达尔文的进化论使人类正确认识到人与自然的关系，而马克思发现的人类历史的发展规律则让人们正确认识到人与社会的关系。
2．“不仅如此”的“此”指代“马克思发现了人类历史的发展规律”。由人类历史发展的一般规律进而发现了资本主义社会的特殊的运动规律，即剩余价值学说，使文章内容又推进一层。“不仅如此”是由一般向特殊的过渡和深入。“一生中能有这样两个发现”指代的是“人类历史的发展规律”和“剩余价值学说”这两个发现。
3．后者的“喜悦”程度更深些。既然两种科学发现都令马克思感到喜悦，就表明马克思对任何科学理论均高度重视；但后者喜悦程度深，则表明马克思对与实践有密切联系的科学发现兴趣尤为浓厚。马克思是站在实践的高度上看待科学理论的，他认为理论的最终目的是应用于实践，理论必须在实践中得以检验和发展。他不是为科学而科学，他更强调科学在实践中的应用。（意对即可）