终止密码子是相对于翻译而言的,终止密码子的作用是终止翻译的进行,使得核糖体从mRNA上解离下来.
而翻译,仅仅是蛋白质合成的第一步,翻译而来的是多肽链,是线性的多肽链,绝大部分翻译来的多肽链是没有任何生物学活性的,还需要进行“翻译后加工”过程,包括N端f-Met或Met的切除、二硫键的形成、肽链的折叠、化学修饰（羰基化、糖基化、磷酸化、酰基化、甲基化）、剪切（水解锻炼或切去一端肽链）以及亚基之间或者亚基与辅基之间的聚合.
另外要说明,不知道楼主说的“对多肽链产生影响是对蛋白质合成不产生影响”值得是什么哦.
终止密码在翻译过程中是必不可少的,如果有终止密码,那么是正常的,对蛋白质的合成影响,只能说对翻译起终止作用.
当然了,如果3'末端有过个终止密码子,以最前面的那个为准,后面的无效,而且目前也没有任何研究表明,增加终止密码子会对翻译的终止有什么加强作用.