生物论文中的fold enrichment是什么意思?

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  • Fold Enrichment = 就是富集倍数[生物学的专用词汇,表示数值单位]

    用法例如:

    1.用干扰RNA质粒转染细胞,然后对转染前后的细胞标本进行了ChIP-qPCR实验,最后计算得到转染前的富集倍数[Fold enrichment] 为30,转染后的[Fold enrichment]富集倍数 为600.是否说明,转染后抗体沉淀下来的蛋白所结合的DNA的量增加了20倍(600/30).

    2.如果要比较两个样品之间的pull down的DNA的多少,仅计算富集倍数是不够的,这个富集倍数是针对于指单个样品,pull down的DNA相对于原来的基因组DNA(Input)的富集程度,pull down的DNA是Input的20倍,那这个20就是富集倍数.

    但是要两个样品之间的原来的基因组DNA的拷贝数(input) 是不一样的,所以还要将不同样品的原来的基因组DNA的进行标准化,也就是分别比较各自的input以后得到的富集倍数再进行比较,这个值才是两个样品之间的差异.