解题思路：（1）将小球动能的大小通过纸盒移动的距离来反映，是一种转换的思想；
（2）根据控制变量法的思想，要研究动能大小与质量的关系，就要保持速度相同；
（3）物理实验的科学探究过程包含多个探究环节：提出问题、猜想、设计实验、进行实验、分析论证、评估等．
（1）动能大小体现在对外做功的多少，可以通过纸盒移动的距离来比较动能的大小；
（2）甲乙两次让小球从斜面上同一位置A滚下是为了控制小球的速度相等；
（3）设计实验是探究物理问题的重要环节之一；
故答案为：（1）纸盒移动的距离；（2）小球到达水平面时的速度相等；（3）设计实验．
点评：
本题考点： 探究影响物体动能大小的因素．
考点点评： 此实验采用了科学的研究方法：控制变量法和转换法．