解题思路：因为两圆只有一个公共点，所以这两个圆是外切或内切，则这两个圆的公切线共有1条或3条．
∵两个半径不相等的圆的圆心都在x轴上，这两个圆的一个公共点的坐标为（-3，0），
∴这两个圆是外切或内切，则这两个圆的公切线共有1条或3条．
故选D．
点评：
本题考点： 圆与圆的位置关系；坐标与图形性质．
考点点评： 主要考查了圆与圆之间的位置关系和有关公切线的知识．数量关系：外离：d＞R+r，四条公切线；外切：d=R+r，三条公切线；相交：R-r＜d＜R+r，两条公切线；内切：d=R-r，一条公切线；内含：d＜R-r，当d=0时，两圆同心．