A、生物圈是地球上所有生物与其生存的环境构成的一个生态系统，生物部分包括生产者、消费者还有分解者，非生物部分包括阳光、空气、水、温度等，是最大的生态系统．不符合题意．
B、在自然生态系统中，各种生物的数量和种类总是维持在相对稳定的状态，而不是数量的绝对不变或相等．不符合题意．
C、自然界中各种生物的能量归根结底来自于光能，不符合题意．
D、在自然生态系统中，各种生物的数量和种类总是维持在相对稳定的状态，达到生态平衡，如果大大减少或增加某一种生物的数量，将最终危及生态系统的稳定，生产者的数量减少，而使其他生物失去物质来源．因此，一个生态系统遭到严重破坏的主要标志是生产者大量减少．符合题意．
故选：D