解题思路：分析图中装置可知，大豆种子能够进行有氧呼吸，有氧呼吸过程中吸收氧气，呼出等量的二氧化碳，因此气体量的变化可能导致U型管中液面的变化．
（1）当A液为水时，由于种子进行有氧呼吸，吸进氧气，呼出等量的二氧化碳，但是由于呼吸作用过程中放出热量，温度升高，广口瓶中压强增大，因此U形管左边液面下降，右边液面升高，即U形管中B液将会出现上升现象．
（2）当A液为Ca（OH）2时，大豆种子呼吸作用消耗氧气，产生的二氧化碳被Ca（OH）2吸收，导致广口瓶中压强减小，因此U形管中左边液面升高，右边液面降低．
（3）有氧呼吸包括三个阶段，其中第一阶段发生在细胞质基质中，二三两个阶段发生在线粒体中，因此在第一阶段中产生的丙酮酸和[H]将运输进入线粒体中进行反应；而通过有氧呼吸第二阶段产生的二氧化碳和二三两个阶段产生的ATP将从线粒体中运出．
故答案为：
（1）上升 呼吸作用放热，温度升高，广口瓶中压强增大，因此U形管左边液面下降，右边液面升高
（2）下降大豆种子呼吸作用消耗氧气，产生的二氧化碳被Ca（OH）2吸收，导致广口瓶中压强减小，因此U形管中左边液面升高，右边液面降低
（3）CO2、ATP 丙酮酸、[H]
点评：
本题考点： 细胞呼吸的过程和意义．
考点点评： 本题考查了呼吸作用的有关知识，考生要能够根据呼吸作用过程中的物质变化和能量变化对实验装置进行分析，明确两种溶液对实验的影响；并根据其中的物质变化判断第三小题，难度适中．