解题思路：假说演绎法包括“提出问题→作出假设→演绎推理→实验检验→得出结论”五个基本环节．孟德尔通过运用统计学方法对一对相对性状的杂交实验分析发现F2都是3：1的分离比；揭示实验现象时孟德尔提出Fl产生配子时，成对的遗传因子彼此分离的假说；提出假说，依据假说进行演绎，若F1产生配子时成对的遗传因子分离，则测交实验后代应出现两种表现型，且比例为1：1；假说能解释自交实验，但是否成立需要通过实验去验证，最终得出结论．
A、等位基因随同源染色体分开而分离的同时，非同源染色体上的非等位基因的自由组合，属于基因自由组合定律的结论，A正确；
B、孟德尔在探究自由组合定律的过程中，根据具有两对相对性状的亲本杂交，F2的表现型之比为9：3：3：1，提出了假说，B正确；
C、F1与双隐性亲本测交，后代表现型之比为1：1：1：1，属于假说的验证，C错误；
D、雌雄配子结合的机会均等，属于假说的内容之一，D错误．
故选：B．
点评：
本题考点： 基因的自由组合规律的实质及应用
考点点评： 本题考查孟德尔的研究过程的相关知识，意在考查学生运用所学知识与观点，通过比较、分析与综合等方法对某些生物学问题进行解释、推理，做出合理的判断或得出正确的结论．