解题思路：生命系统的结构层次：细胞→组织→器官→系统→个体→种群→群落→生态系统→生物圈．其中细胞是最基本的生命系统结构层次，生物圈是最大的结构层次．
A、生命系统的各个层次可以相互联系，如细胞和个体、生态系统之间，A正确；
B、生命大分子如蛋白质、核酸不属于生命系统的结构层次，B错误；
C、变形虫为单细胞动物，故一个变形虫既可以说是细胞生命层次，也可以说是个体生命层次，C正确；
D、不是任何生物都具备全部不同层次的生命系统，如植物无系统层次，单细胞生物无组织、器官层次，D正确．
故选：B．
点评：
本题考点： 细胞的发现、细胞学说的建立、内容和发展．
考点点评： 本题知识点简单，考查生命系统的结构层次，只要考生识记生命系统的结构层次即可正确答题，属于考纲识记层次的考查．此类试题，需要考生掌握牢固的基础知识．