解题思路：基因突变是基因结构的改变，包括碱基对的增添、缺失或替换．
基因重组的方式有同源染色体上非姐妹单体之间的交叉互换和非同源染色体上非等位基因之间的自由组合．染色体变异是指染色体结构和数目的改变．
染色体结构的变异主要有缺失、重复、倒位、易位四种类型．染色体数目变异可以分为两类：一类是细胞内个别染色体的增加或减少，另一类是细胞内染色体数目以染色体组的形式成倍地增加或减少．明确知识点，梳理相关知识，根据选项描述结合基础知识做出判断．
A、强烈的核辐射会损伤细胞的DNA，引起基因突变或染色体缺失等结构变异，A正确；
B、DNA分子中基因片段中碱基对的增添和缺失属于基因突变，同源染色体的非姐妹染色单体的交叉互换会导致基因重组，如果交叉互换的部分含有相同的基因，则没有发生基因重组，B错误；
C、生物的性状是遗传物质与环境共同作用的结果，所以性状发生改变，控制相关性状的基因可能未发生改变，C正确；
D、基因突变是分子水平的变异，能产生新的等位基因，可能使种群的基因频率发生改变，D正确．
故选：B．
点评：
本题考点： 基因突变的特征；基因重组及其意义．
考点点评： 本题考查可遗传变异来源的相关知识，意在考查学生的识记能力和判断能力，运用所学知识综合分析问题的能力．