解题思路：合成ATP的能量来自呼吸作用或光合作用；场所在线粒体，叶绿体，细胞质基质．
①线粒体是进行有氧呼吸的主要场所，能释放大量的能量，部分用于合成ATP，故①正确；
②内质网是有机物的合成“车间”，蛋白质运输的通道，需要消耗ATP，故②错误；
③叶绿体中类囊体膜上进行光反应，把光能转化成ATP中活跃的化学能，故③正确；
④核糖体将氨基酸缩合成蛋白质，需要消耗ATP，故④错误；
⑤细胞质基质是进行有氧呼吸第一阶段和无氧呼吸的场所，能释放少量的能量，部分用于合成ATP，故⑤正确．
故选：D．
点评：
本题考点： ATP与ADP相互转化的过程；线粒体、叶绿体的结构和功能．
考点点评： 本题考查ATP合成的场所，意在考查学生的识记和理解能力，难度不大．