解题思路：水分以气体状态通过叶片表皮上的气孔从植物体内散失到植物体外的过程叫做蒸腾作用；植物体从土壤中吸收的水分大部分用于蒸腾作用．
A、绿色植物通过叶绿体，利用光能，把二氧化碳和水转化成储存能量的有机物，并且释放出氧气的过程，叫做光合作用；小麦吸收的水分只有一少部分用于光合作用．A错误．
B、细胞利用氧，将有机物分解成二氧化碳和水，并且将储存在有机物中的能量释放出来，供给生命活动的需要的过程叫做呼吸作用；呼吸作用不利于小麦吸收的水分．B错误．
C、不管小麦处于什么时期，其吸收的水分99%用于了蒸腾作用．C正确．
D、小麦进行光合作用积累有机物，而光合作用只是利用了很少一部分水．D错误．
故选：C
点评：
本题考点： 蒸腾作用的意义．
考点点评： 知道：植物体吸收的水分大部分用于蒸腾作用．