解题思路：利用棱柱、正棱柱、正棱台、正棱锥的概念与几何特征对A、B、C、D四个选项逐一分析判断即可．
对于A，长方体是四棱柱，在六个表面中有三对面相互平行，故A错误；
对于B，∵正棱柱的底面是正多边形，且是直棱柱，
∴底面是正方形的直四棱柱是正四棱柱，正确；
对于C，正棱台的底面是正多边形，且棱台之侧棱延长后的交点在两底面的射影均为正多边形的中心（或用平行于底面的平面去截正棱锥，截面与底面之间的部分为正棱台），故C错误；
对于D，正四棱锥的底面是正方形，且棱锥顶点在底面的射影为正方形的中心，故D错误；
综上分析，判断正确的是B．
故选：B．
点评：
本题考点： 命题的真假判断与应用；棱柱的结构特征；棱锥的结构特征．
考点点评： 本题考查命题的真假判断与应用，着重考查棱柱、棱锥、与棱台的结构特征，属于中档题．