我不知道你原来的问题是什么,就这个问题,我做些解释,也许有些帮助.
首先是概念：蛋白质和多肽：
多肽是三个或三个以上氨基酸缩水形成的肽链.多肽到一定长度后,可以被认为是蛋白质了,（这个长度不确定,有的20多个氨基酸算,有的50多个算,没有一个固定标准,只是根据多肽的功能,来确定是否为蛋白质）.
顺着上面的意思,蛋白质就是多肽,或由多肽组成的.后半句意思是,蛋白质除了多肽外,可以对：1.多肽进行修饰,比如糖基化,烷基化,磷酸化,甲基化等等 2.多个多肽组合形成蛋白质,比如 通过2硫键,通过金属离子耦合等等.
因此,蛋白质可以是多肽,但有不局限于纯粹的多肽,可以是多肽组合,可以带有多肽修饰等.
弄清了上面概念,你可以理
蛋白质水解,就是蛋白质先水解成多肽或直接水解成氨基酸（根据蛋白质的大小,或长度,也许他就是氨基酸残基较少的多肽）.
若水解成多肽,多肽进一步水解形成氨基酸.
“都说氨基酸脱水缩合形成蛋白质,多肽的结构就是蛋白质的结构了,怎么可能多肽还是去失水形成蛋白质呢- -”
这句话不严谨,应该说：多肽的氨基酸顺序是蛋白质的一级结构.
多肽的氨基酸顺序就是蛋白质的一级结构,蛋白质的高级结构是由一级结构决定的.
多肽的合成,在体内是通过翻译mRNA,在核糖体上将氨基酸按照mRNA的序列,翻译成多肽序列.也是个失水缩合过程,不过,过程很复杂.
但愿有所帮助.