解题思路：由我们所学的知识可以知道：（1）植物的种子是由种皮和胚组成的，而胚是由胚根、胚芽、胚轴和子叶组成的，为种子的主要部分．
（2）大多数的双子叶植物的种子中的营养物质储存在子叶，而大多数的单子叶植物的种子中的营养物质储存在胚乳．
（3）种子是由保护组织、营养组织等构成的器官．
据此可以解答本题．
答：A：植物中的胚能发育成新个体，是种子的主要部分，不符合题意为错误项．
B：大多数的双子叶植物的种子中的营养物质储存在子叶，而大多数的单子叶植物的种子中的营养物质储存在胚乳，不符合题意为错误项．
C：胚是由胚根、胚芽、胚轴和子叶组成的，不包括胚乳，不符合题意为错误项．
D：种子是绿色植物的六大器官之一，它不是细胞，是错误的，符合题意．
故选D
点评：
本题考点： 种子的结构和成分．
考点点评： 大多数学生认为胚乳是胚的一部分，容易选错．