解题思路：本题是对观察植物细胞的质壁分离和复原、探究细胞表面积与体积之比与物质运输的效率关系、土壤小动物类群的丰富度的研究、探究土壤微生物的分解作用等实验的综合性考查，回忆观察植物细胞的质壁分离和复原、探究细胞表面积与体积之比与物质运输的效率关系、土壤小动物类群的丰富度的研究、探究土壤微生物的分解作用等实验的相关知识点，然后分析选项进行解答．
A、洋葱鳞片叶外表皮细胞含有成熟的大液泡，可以通过渗透作用吸水或失水，且洋葱鳞片叶外表皮细胞液泡呈现紫色，便于观察液泡的大小变化，因此常用洋葱鳞片叶外表皮细胞为材料观察细胞的质壁分离和复原，A错误；
B、许多土壤小动物有较强的活动能力，且身体微小，因此不适于用样方法和标记重捕法调查，常用取样器取样的方法进行采集、调查，B错误；
C、NaOH进入琼脂块的速率是相同的，与琼脂块的大小无关，紫红色区域的体积与整个琼脂块的体积之比表示的是运输效率，不是运输速率，C错误；
D、探究土壤微生物的分解作用”实验中，实验组将土壤用塑料袋包好，放在60℃的恒温箱中灭菌1h的目的尽可能排除土壤微生物的作用，同时尽可能防止土壤理化性质发生改变，D正确．
故选：D．
点评：
本题考点： 观察植物细胞的质壁分离和复原；探究细胞表面积与体积的关系；土壤中动物类群丰富度的研究；土壤中能分解纤维素的微生物及其应用价值．
考点点评： 本题的知识点是观察植物细胞的质壁分离和复原的材料选择，土壤小动物类群的丰富度的研究选用的方法，“探究细胞大小与物质运输的关系”实验的结论，“探究土壤微生物的分解作用”实验中60℃的恒温箱中灭菌的目的，对于相关知识点的记忆是解题的关键．