A、滤纸的边缘低于漏斗的边缘,正确;
B、过滤时液面要低于滤纸边缘,以防液体顺着滤纸与漏斗间的空隙流下,过滤不彻底,故B错误;
C、玻璃棒靠在三层滤纸的一边,防止戳破滤纸,正确;
D、漏斗下端管口紧靠烧杯内壁,防止液体溅出,正确.
故选B.