（1）设平安客运公司45座和35座的客车每辆每天的租金分别是x元、y元，由题意得：
x-y=100
5x+3y=6100 ，
解得：
x=800
y=700 ，
答：平安客运公司45座和35座的客车每辆每天的租金分别是800元、700元；
（2）45座客车平均人均票价为800÷45=17
7
9 （元），
35座客车平均人均票价为700÷35=20（元），
∵17
7
9 ＜20，
∴多租45座的客车，
九年级师生总数：45×8-20=340（人），
∵340÷45=7…25，
∴租45座客车6辆，35座客车2辆，此时没有空位，租金最少．