解题思路：蛋白质的结构多样性与氨基酸的数目、种类、排列顺序，肽链的盘曲、折叠方式及其形成的空间结构有关．
蛋白质的功能具有多样性：结构蛋白（如血红蛋白）、催化功能（如蛋白质类的酶）、运输功能（如载体蛋白）、调节功能（如胰岛素）、免疫功能（如抗体）等．
分泌蛋白最初是在内质网上的核糖体中由氨基酸形成肽链，肽链进入内质网进行初步的加工后，进入高尔基体经过进一步的加工形成分泌小泡与细胞膜融合，分泌到细胞外．
A、高尔基体能对来自内质网的蛋白质进行加工、分类、包装及转运，所以真核细胞分泌蛋白质需要高尔基体参与，A正确；
B、蛋白质中大分子物质，不能通过主动转运进出细胞膜，需要通过胞吞和胞吐方式进出细胞，B错误；
C、氨基酸种类和数量相同的蛋白质，其排列顺序及其形成的空间结构不一定相同，所以功能相同，C错误；
D、生物多样性的直接原因是由于蛋白质结构的多样性，根本原因是DNA分子结构的多样性，D错误．
故选：A．
点评：
本题考点： 蛋白质的结构和功能的综合．
考点点评： 本题考查蛋白质结构和功能的相关知识，意在考查学生的识记能力和判断能力，运用所学知识综合分析问题的能力．