解题思路：酵母菌无氧呼吸的反应式是：C6H12O6 酶2C2H5OH+2CO2+能量，有氧呼吸的反应式是：C6H12O6+6H2O+6O2 酶6CO2+12H2O+能量．
A、酵母菌是真核生物具有线粒体，A错误；
B、由酵母菌无氧呼吸的反应式可知，酵母菌无氧呼吸过程产生的乙醇与二氧化碳的物质的量相等，B正确；
C、糖酵解是发酵的第一阶段，不是发酵的主要过程，C错误；
D、生产啤酒时会有CO2的释放，用发酵法生产面包，也会产生二氧化碳，D错误．
故选：B．
点评：
本题考点： 有氧呼吸的过程和意义；无氧呼吸的概念与过程．
考点点评： 对于酵母菌有氧呼吸与无氧呼吸过程的掌握及在生产、生活中的应用是解题的关键．