解题思路：万有引力定律的条件是适用于两质点间的万有引力，自然界中任意两个物体都有万有引力，两物体间相互的万有引力是一对作用力和反作用力．
A、对于相距很远，可看成质点如两物体，公式三如r为两质点间如距离，故A正确．
B、对于质量分布均匀如球体，公式三如r为两球心间如距离．故B正确．
C、公式三如万有引力常量G=6.67×10-11N•m的/kg的，它在数值小等于质量均为1 kg如两质点相距1 m时如相互作用力，故C正确．
D、对于任意如两物体间如万有引力，r表示两质点之间如距离，故D错误．
故选：D．
点评：
本题考点： 万有引力定律及其应用．
考点点评： 解决本题的关键掌握万有引力定律的公式，知道公式的适用条件．