解题思路：阅读题干和题图可知，本题是通过实验探究基因与染色体的关系，先分析题图实验方法和实验现象获取信息，然后根据问题涉及的具体内容分析综合进行解答．
（1）分析题图实验一可知，红眼果蝇与白眼果蝇杂交，F1表现红眼，F2红眼与白眼之比是3：1，符合孟德尔遗传的基因分离定律，但实验一F2中眼色的性状表现与性别相关联．
（2）若控制白眼的基因是隐性基因，且位于X染色体上，Y染色体上没有它的等位基因，则白眼雌果蝇的基因型是XbXb，红眼雄果蝇的基因型是XBY，杂交后代的基因型是XBXb、XbY雌果蝇全部是红眼，雄果蝇全是白眼，所以表格实验中实验三，F1的雄蝇均为白眼，雌蝇均为红眼支持控制白眼的基因是隐性基因，且位于X染色体上，Y染色体上没有它的等位基因这一观点．
（3）实验证明摩尔根的假设是成立的，分析表格实验可知，实验一亲本基因型是XBXB和XbY，F1的基因型是XBXb和XBY，F2的基因型是XBXB、XBXb、XBY、XbY，其中XBXB、XBXb表现为红眼雌性；欲检测实验一中F1红眼雌果蝇眼色的基因组成，可以让F1红眼雌果蝇与白眼雄果蝇XbY杂交．
故答案为：
（1）基因分离 性别
（2）三
（3）XBXB或XBXb XbY白眼雄果蝇
点评：
本题考点： 基因的分离规律的实质及应用；伴性遗传．
考点点评： 本题考查基因的分离定律、伴性遗传和基因与染色体关系的相关知识，意在考查学生的图表分析能力和判断能力，运用所学知识综合分析问题的能力．