解题思路：科学探究的一般过程包括提出问题、作出假设、制定计划（即探究的方案：包括选择材料、设计方法步骤等）、实施计划、得出结论（分析所得的结果与假设是否相符）、表达和交流．
（1）方法一：
提出问题：尝试从日常生活、生产实际或学习中发现与生物学相关的问题．尝试书面或口头表述这些问题．描述已知科学知识与所发现问题的冲突所在，一定是问句“？”：大花生结出的果实一定大些吗？
作出假设：应用已有知识，对问题的答案提出可能的设想．估计假设的可检验性．对提出问题作出肯定或否定的回答：大花生结出的果实比小花生结出的果实大些．
得出结论：描述现象、处理数据、对假设作出肯定或否定：大花生果实长度的平均值应大于小花生果实的平均值．这种差异主要是由于遗传物质的差异引起的．
（2）方法二：
提出问题：相同大小的花生在不同的条件下结出的果实一样大吗？
作出假设：相同大小的花生在不同的条件下结出的花生果实大小不同．
得出结论：大花生在不同的条件下结出的果实不相同（大小差异很大）这主要是由环境引起的变异．
（3）花生果实长度的变异，有的是遗传物质的变化引起的，有的是环境引起的．由遗传物质改变引起的变异是可以遗传的，仅由环境引起而遗传物质未发生改变的变异是不能遗传的．
故答案为：（1）大花生结出的果实一定大些吗；
大花生结出的果实比小花生结出的果实大些；
大花生结出的果实要大些（平均）．
（2）相同大小的花生在不同的条件下结出的果实一样大吗；
相同大小的花生在不同的条件下结出的花生果实大小不同；
相同大小的花生在不同的条件下结出的果实不相同（大小差异很大）．
（3）遗传物质；遗传给后代；环境；遗传给后代．
点评：
本题考点： 探究花生果实大小的变异．
考点点评： 探究成功的前提是能够提出有研究价值的问题，并作出符合科学事实的假设；探究成功的关键是制定出恰当的科学探究计划．探究计划包括方法和步骤，以及所需要的材料用具等．