解题思路：噬菌体侵染细菌的过程：吸附→注入（注入噬菌体的DNA）→合成（控制者：噬菌体的DNA；原料：细菌的化学成分）→组装→释放．噬菌体侵染细菌的实验步骤：分别用35S或32P标记噬菌体→噬菌体与大肠杆菌混合培养→噬菌体侵染未被标记的细菌→在搅拌器中搅拌，然后离心，检测上清液和沉淀物中的放射性物质．
A、由于噬菌体外壳蛋白质没有进入细菌，所以该实验无法证明蛋白质不是遗传物质，A正确；
B、噬菌体进入细菌的只有DNA，所以侵染过程的原料、ATP、酶、场所等条件均由细菌提供，B正确；
C、由于检测放射时无法检测是32P还是35S发出的，所以如用32P、35S共同标记一组噬菌体的DNA和蛋白质，则无法确认何种物质注入了细菌体内，C错误；
D、由于DNA分子复制是半保留复制，所以连续培养噬菌体3代，含母链的DNA应占子代DNA总数的[2/8]=[1/4]，D正确．
故选：C．
点评：
本题考点： 噬菌体侵染细菌实验；DNA分子的复制．
考点点评： 本题考查噬菌体侵染细菌实验的相关知识，意在考查学生的识记能力和判断能力，运用所学知识综合分析问题和解决问题的能力．