解题思路：1、DNA分子结构的主要特点：DNA是由两条反向平行的脱氧核苷酸长链盘旋而成的双螺旋结构；DNA的外侧由脱氧核糖和磷酸交替连接构成的基本骨架，内侧是碱基通过氢键连接形成的碱基对，碱基之间的配对遵循碱基互补配对原则（A-T、C-G）．
2、基因是有遗传效应的DNA片段．
某染色体上的DNA分子中碱基G的比例为20%，根据碱基互补配对原则，该DNA分子中碱基C的比例也为20%，而基因只是有遗传效应的DNA片段，因此不能确定该DNA上某基因中碱基C的比例．
故选：D．
点评：
本题考点： DNA分子结构的主要特点．
考点点评： 本题考查DNA分子结构的主要特点，要求考生识记DNA分子结构的主要特点，掌握碱基互补配对原则，明确该DNA分子中的C=G=20%；识记基因的概念，明确基因是DNA的片段，根据DNA中某种碱基的比例不能判断该DNA的一个片段中某种碱基的比例．