解题思路：分析表格：限制酶Sma I的识别序列是CCCGGG，在C和G之间切割；限制酶Xma I的识别序列是CCCGGG，在第一个C和第二个C之间切割．
分析图1、图2：质粒只有EcoR I酶和Pst I酶的识别位点，外源DNA分子含有Mse I酶、EcoR I酶和Pst I酶识别位点，且切割获得目的基因需要Mse I酶和Pst I酶．
分析图3：质粒上含有两个抗性基因，即四环素抗性基因和青霉素抗性基因．对质粒进行改造时，已将青霉素抗性基因破坏，所以含重组质粒的大肠杆菌能在含有四环素的培养基上生存，但在含有青霉素的培养基上不能生存．
（1）限制酶Sma I的识别序列是CCCGGG，在C和G之间切割；限制酶Xma I的识别序列是CCCGGG，在第一个C和第二个C之间切割．由此可见，这两种酶的识别的序列相同，但切割位点不同．
（2）因为CG碱基对间有三个氢键，而AT碱基对间有两个氢键，可见AT碱基对间氢键数少，这使DNA双链解旋更容易，所以复制原点的碱基序列特点通常含A、T碱基较多．
（3）图中质粒只有EcoR I酶和Pst I酶的识别位点，而切割目的基因需要Mse I酶和Pst I酶，所以需要对质粒进行改造，在质粒上构建新的限制酶切位点，即Mse I酶切位点．首先用EcoR I酶处理质粒；然后用DNA聚合酶等处理质粒；再运用DNA连接酶处理质粒，从而形成新的限制酶切位点，即可被Mse I酶识别．
（4）由图可知，质粒上含有两个抗性基因，即四环素抗性基因和青霉素抗性基因．对质粒进行改造时，已将青霉素抗性基因破坏，所以含重组质粒的大肠杆菌能在含有四环素的培养基上生存，但在含有青霉素的培养基上不能生存．所以图中培养基除了含有细菌生长繁殖必需的成分外，培养基A和培养基B分别还含有四环素和青霉素，在含有四环素的培养基上能生存，在含有青霉素的培养基上不能生存的4和6菌落就是含有目的基因的菌落．
故答案：（1）识别的序列相同 催化反应的结果却不同（切割位点不同）
（2）AT碱基对间氢键数少，使DNA双链解旋更容易
（3）EcoRI DNA连接 MseI
（4）四环素 青霉素（青霉素和四环素） 4和6
点评：
本题考点： 基因工程的原理及技术．
考点点评： 本题结合图表，考查基因工程的相关知识，意在考查考生分析图表获取有效信息的能力；理解所学知识要点，把握知识间内在联系的能力；能运用所学知识与观点，通过比较、分析与综合等方法对某些生物学问题进行解释、推理，做出合理的判断或得出正确的结论．