解题思路：1、本题主要考查了现代生物进化理论的内容．
种群是生物进化的基本单位，生物进化的实质是种群基因频率的改变．突变和基因重组，自然选择及隔离是物种形成过程的三个基本环节，通过它们的综合作用，种群产生分化，最终导致新物种形成．在这个过程中，突变和基因重组产生生物进化的原材料，自然选择使种群的基因频率定向改变并决定生物进化的方向，隔离是新物种形成的必要条件．
2、基因频率的计算方法：
（1）基因频率=
种群中该基因的总数/种群中该等我基因的总数]×100%．基因频率及基因型频率；
（2）一个等位基因的频率=该等位基因纯合子的频率+[1/2]杂合子的频率；
（1）该种群的全部个体所含有的全部基因称为种群的基因库，经观察，该种群中果蝇有多种多样的基因型，分析其产生的原因，是在突变过程中产生的等位基因，通过有性生殖中的基因重组而产生的，使种群中产生了大量的可遗传的变异，其产生的方向是不定向，其来源包括基因突变、基因重组和染色体变异．它们都能为生物进化提供原材料，但不能决定生物进化的方向．
（2）假定该种群中每个基因的突变率都是10-5，那么在该种群中每一代出现的基因突变数是107×104×2×10-5=2×106．
（3）A基因的频率为：A=[35×2+60
(35+60+5)×2=65%；a基因频率为：a=1-65%=35%．
（4）不同的果蝇种群之间，一旦发生了生殖隔离，就不会有基因交流，即标志着新物种的形成．
故答案为：
（1）基因库 等位基因 基因重组 变异 不定向的 基因突变 基因重组 染色体变异 原材料 方向
（2）2×106
（3）65% 35%
（4）生殖 基因
点评：
本题考点： 基因频率的变化；现代生物进化理论的主要内容；物种的概念与形成．
考点点评： 本题主要考查学生对知识的记忆和理解能力．现代生物进化理论的主要内容是学习的重点知识．要注意辨析，种群基因频率改变意味着生物进化了，但不一定产生新的物种．新物种的产生必须要发生生殖隔离．
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