（1） 内源性抗原的加工（MHCⅠ类途径）
APC摄取的内源性抗原经蛋白酶体（LMP）降解成肽,通过抗原加工相关转运体（TAP1、TAP2）转运进入内质网,与MHCⅠ类分子（在内质网合成）结合成肽－MHCI类复合物,通过高尔基体表达于细胞表面,供CD4+T细胞识别.
（2） 外源性抗原的加工（MHCⅡ类途径）
APC摄取的外源性抗原在内体中降解成肽,与MHCⅡ类分子（在内质网合成）结合后表达于细胞表面,供CD8+T细胞识别.外源性抗原加工中需要Ii链和HLA-DM分子的参与.Ii链与MHCⅡ类分子的转运有关,并通过CLIP封闭MHCⅡ类分子的肽结合部位,阻止Ⅱ类分子在内质网中与内源性抗原肽结合.HLA-DM分子促使CLIP从MHCⅡ类分子肽结合区解离,有利抗原肽与MHCⅡ类分子结合.